O dia feliz foi 04 de agosto de 1990, dia de São João Maria Vianney, então patrono dos párocos e, desde o Ano Sacerdotal, patrono de todos os padres. No mesmo ano, o Pe. Pedro tornou-se vigário paroquial da Paróquia Cristo Operário e Santo Cura d’Ars. No ano seguinte, pároco da Paróquia São Francisco de Assis. Ambas no Rio de Janeiro. De 1991 a 1993 foi diretor dos estudantes no Seminário São José, da arquidiocese de São Sebastião do Rio de Janeiro.
De 1993 a 1996 graduou-se em Teologia Moral na Pontifícia Universidade Gregoriana e a pós-graduou-se em Filosofia na Pontifícia Universidade Santa Cruz, ambas em Roma. De 1996 a 1998, foi pároco da Paróquia Santa Teresa de Jesus. E a partir desse ano foi pároco da paróquia Santa Rita de Cássia, no centro histórico do Rio. Foi ainda professor de Filosofia na PUC (Pontifícia Universidade Católica) e diretor da Faculdade Eclesiástica de Filosofia João Paulo II, na Arquidiocese do Rio de Janeiro. Aos 24 de novembro de 2010 o Papa Bento XVI nomeou-o bispo auxiliar da Arquidiocese de São Sebastião do Rio de Janeiro. Em 05 de fevereiro de 2011 o Mons. Pedro Cunha Cruz recebeu a plenitude do sacramento da Ordem, no grau do episcopado.
Nossa Igreja local celebra hoje, com júbilo, o sacerdócio pleno de seu antístite, ao mesmo tempo que se alegra pelo sacerdócio de sua centena de presbíteros. E louva o bom pastor, Jesus Cristo, filho unigênito de Deus, por não deixar faltar à sua Igreja os sacerdotes necessários para o seu legítimo governo, sua liturgia santificante e seu frutuoso pastoreio, tão necessários à edificação do Reino de Deus entre nós.
Parabéns, Dom Pedro! Parabéns a todos os sacerdotes!